Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms