Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-5Q9HDB9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms