Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIFKQ9BYG3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms