Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RSPO3Q9BXY4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RSPO3Q9BXY4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RSPO3Q9BXY4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms