Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3R4Q99570 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms