Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSRNP1Q96S65 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms