Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP47Q96K76 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms