Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LRRIQ1Q96JM4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRIQ1Q96JM4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
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