Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZBED3Q96IU2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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