Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC34Q96HJ3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms