Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNFT2Q96EX2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms