Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAVIN3Q969G5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms