Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP9XQ93008 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP9XQ93008 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms