Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SncbQ91ZZ3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SncbQ91ZZ3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms