Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF548Q8NEK5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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