Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARMIL3Q8ND23 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CARMIL3Q8ND23 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms