Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPAP2Q8IXW5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPAP2Q8IXW5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms