Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NPAS3Q8IXF0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms