Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATG4DQ86TL0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms