Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RUFY3Q7L099 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms