Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf139Q6ZV77 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms