Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GARNL3Q5VVW2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms