Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDK2Q58EX2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms