Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D3Q587I9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms