Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYTL3Q4VX76 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SYTL3Q4VX76 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms