Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MICAQ29983 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MICAQ29983 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MICAQ29983 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MICAQ29983 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MICAQ29983 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MICAQ29983 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms