Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIDA1Q1XH10 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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