Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDB1Q16531 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
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