Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms