Protein–RNA interactions for Protein: Q14CS0

UBXN2B, UBX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2BQ14CS0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
UBXN2BQ14CS0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN2BQ14CS0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms