Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms