Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1orf61Q13536 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms