Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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MKRN4PQ13434 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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MKRN4PQ13434 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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MKRN4PQ13434 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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MKRN4PQ13434 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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MKRN4PQ13434 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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MKRN4PQ13434 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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MKRN4PQ13434 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
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