Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP3B2Q13367 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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