Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXL1Q08397 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms