Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABPAQ06546 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPAQ06546 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms