Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPN11Q06124 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms