Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EMX2Q04743 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms