Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP7AQ04656 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms