Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TOP2BQ02880 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TOP2BQ02880 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms