Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTBN1Q01082 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms