Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDK3Q00526 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK3Q00526 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms