Protein–RNA interactions for Protein: P78559

MAP1A, Microtubule-associated protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1AP78559 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1AP78559 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1AP78559 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1AP78559 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1AP78559 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1AP78559 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1AP78559 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1AP78559 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1AP78559 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1AP78559 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1AP78559 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1AP78559 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1AP78559 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1AP78559 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
MAP1AP78559 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
MAP1AP78559 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
MAP1AP78559 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAP1AP78559 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms