Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS29P62273 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS29P62273 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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