Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms