Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms