Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NESP48681 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NESP48681 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NESP48681 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NESP48681 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NESP48681 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NESP48681 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NESP48681 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NESP48681 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NESP48681 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NESP48681 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NESP48681 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NESP48681 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NESP48681 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NESP48681 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NESP48681 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NESP48681 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NESP48681 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NESP48681 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
NESP48681 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NESP48681 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NESP48681 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NESP48681 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NESP48681 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NESP48681 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NESP48681 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NESP48681 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NESP48681 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
NESP48681 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NESP48681 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NESP48681 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NESP48681 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NESP48681 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NESP48681 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NESP48681 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NESP48681 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NESP48681 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NESP48681 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NESP48681 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NESP48681 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
NESP48681 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NESP48681 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NESP48681 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NESP48681 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NESP48681 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NESP48681 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NESP48681 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NESP48681 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NESP48681 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NESP48681 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NESP48681 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NESP48681 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NESP48681 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NESP48681 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NESP48681 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NESP48681 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
NESP48681 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NESP48681 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NESP48681 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NESP48681 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NESP48681 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NESP48681 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NESP48681 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NESP48681 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
NESP48681 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NESP48681 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NESP48681 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NESP48681 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
NESP48681 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NESP48681 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NESP48681 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NESP48681 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NESP48681 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NESP48681 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NESP48681 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NESP48681 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NESP48681 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NESP48681 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NESP48681 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NESP48681 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NESP48681 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NESP48681 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NESP48681 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NESP48681 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NESP48681 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NESP48681 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NESP48681 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NESP48681 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NESP48681 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NESP48681 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
NESP48681 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NESP48681 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NESP48681 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NESP48681 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NESP48681 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NESP48681 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NESP48681 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NESP48681 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NESP48681 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NESP48681 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms