Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE6BP35913 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms