Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPB2P35606 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPB2P35606 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPB2P35606 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPB2P35606 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPB2P35606 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPB2P35606 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPB2P35606 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPB2P35606 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPB2P35606 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPB2P35606 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPB2P35606 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPB2P35606 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPB2P35606 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
COPB2P35606 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPB2P35606 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
COPB2P35606 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPB2P35606 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
COPB2P35606 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPB2P35606 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPB2P35606 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPB2P35606 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPB2P35606 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPB2P35606 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPB2P35606 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPB2P35606 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPB2P35606 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPB2P35606 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPB2P35606 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPB2P35606 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPB2P35606 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPB2P35606 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
COPB2P35606 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPB2P35606 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPB2P35606 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPB2P35606 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPB2P35606 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPB2P35606 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPB2P35606 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPB2P35606 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPB2P35606 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
COPB2P35606 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPB2P35606 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms