Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
ABCC1P33527 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms